В 1996 году  на кафедре философии ОмГПУ была открыта аспирантура по специальности 09.00.01 – Онтология и теория познания, затем кандидатский диссертационный совет по той же специальности. Научными руководителями выступили профессора Денисов С.Ф. и Федяев Д.М., позже к научному руководству присоединились профессора Николин В.В., Орехов С.И., Пузиков В.Г. В 2002 году были открыты  докторантура и докторский диссертационный совет.

В настоящее время на кафедре ведётся обучение в аспирантуре по четырём специальностям:

• 09.00.01 – Онтология и теория познания;

• 09.00.03 – История философии;

• 09.00.11 – Социальная философия

• 09.00.13 – Религиоведение, философская антропология, философия культуры.

За время существования аспирантуры в ней прошло обучение 12 человек, 9 из которых успешно защитили диссертации.

В 2005-2006 уч. году в аспирантуре на кафедре философии обучается 19 человек, в докторантуре 3 человека.